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临床数据分析
案例详情

研究者提出的科学问题:

  1. COVID-19大流行不同阶段(流行前、流行中、流行后),不同国家的SARS-CoV-2主要流行毒株是否与感染儿童的疾病严重程度存在关联?
  2. 不同国家,不同年龄组儿童的疾病严重程度是否有差别?

研究者提供的数据:

来自9个国家的医院电子医疗记录(EHR)数据,数据格式和处理情况各不相同。

我们的服务:采用自动化LytiX系统,我们完成了以下工作:

  1. 分析策略制定: 深入分析科学问题,依据数据情况制定了分析策略,并明确了所要求的数据格式。
  2. 个性化数据预处理: 根据每个国家数据的具体情况,编写了个性化的数据预处理代码,对原始数据进行清洗、整理和整合,使其符合分析要求。
  3. 统计分析与报告撰写: 编写并执行统计分析代码,获得研究结果。撰写全面的分析报告,包括方法、结果、图表以及对结果和图表的解释。

注: 在最新的LytiX系统中,我们在报告撰写功能中加入了背景大纲、简要讨论和写作建议,为研究者提供更全面的指导,帮助他们更好地完成论文写作。

交付成果:

各国医院的病历系统差异巨大,原始数据集高度复杂。尽管研究者已请求各地医院的数据中心协助清洗数据,但受限于人力时间等,大部分医院仅将粗略处理甚至是原始数据发送过来。

首先需要根据研究设计,对不同医院的原始数据进行清洗,整理,并中提取出有用的信息。这项工作极其繁琐,人工无法胜任。即使经验丰富、编码能力强的数据科学家,也需要2-3周才能完成。再加上后续的统计分析和论文撰写,从获取数据到完成论文初稿,保守估计需要2个月。而我们的系统可快速解析数据,1-3天内(包含完善时间)即可完成分析报告。在此基础上,完成论文初稿仅用不到2周,极大地节省了时间和人力成本。

我们交付分析结果,分析报告,全部分析代码(包括数据预处理和分析代码),以确保结果准确,透明,可重复。

研究者在人工抽查核实数据清洗结果并复现分析结果后,自主撰写了研究论文,并成功发表于儿科学顶刊《JAMA Pediatrics》。

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